Selain Pustaka Al-Khoirot, Pondok Pesantren Al-Khoirot juga memiliki TOKO SANTRI suatu usaha yang bergerak dibidang foto copy dan stationary dan berbagai keperluan santri dan siswa.
Pustaka Alkhoirot dan Toko Santri berada dalam satu atap. Yang pengelolaannya dipimpin oleh Mahfudz MD dan Imam Syahrowardi.